休斯顿目前有2条在运营的地铁线路，1条支线。 地铁1号线（蓝色），又称联合地铁（Uptown），北起亨茨尔特公园，南至贝勒医学院，全长6.5英里（约10.4公里），连接了奥斯汀和休斯顿的市中心区域，是休斯顿最早的一条地铁线。
地铁2号线（黄色），南起帕克城，北至休斯顿北部地区，全长38.5英里（约62.0公里），是休斯顿第二条建成通车的地铁线路。 支线路线（绿色），东北起休斯顿市中心，途经南部富人区，终到贝勒医学院，全长约7英里（约11.3公里）。
三条路线共同构成了一个密集的道路网，基本覆盖了整个休斯顿都会区的中心区域。不过，因为建地铁的时候没有考虑停车的问题，所以现在这三条线的站点附近普遍都没有像样的停车场，给乘客带来了不小的不便。另外，除了地铁专线外，市区内还有其他的几条公交线路可以搭乘。
汤遨宇优质答主休斯顿的公共交通由休斯敦运输公司负责经营，包括100多条公交线路，日均客运量37.99万人次 。休斯敦仅有郊区小部分区域由德州长途客车公司运营，德州长途客车公司同时运营三条线路连接休斯敦与加尔维斯顿岛。
2004年5月，休斯敦第一条轻轨线路（红线）正式通车。轻轨系统包括红线和蓝线两条线路，两条线路在市中心交汇，并设有联络线连接两线间的交通。轻轨线路全长约23英里（37千米），设26个车站，日均客运量4.19万人次。轻轨系统在2014年12月完全实现了电气化 。2009年，休斯敦同时开始了新的红线和橙线建设规划，新红线将延伸原来红线长度8.2英里（13.2千米），设8个车站，工程造价7.486亿美元；橙线为全新线路，全长6.3英里（10.1千米），设6个车站，工程造价4.4895亿美元。
休斯敦都市区有南北向的美国国家高速公路90号公路和610号环线等多条公路干线。610号环线内设有10条城市快速路与国家及州干线公路相连。休斯敦没有城市中心区域的环路，车辆进入中心商务区需要绕行其它道路，由此造成该区域交通非常拥堵 休斯顿都市区还是美国联邦政府规定的18个空气污染超标大都市区之一 。
